2010年博士毕业于中国科学院生态环境研究中心，2010年4月-2015年12月于昆士兰大学开展博士后研究。现为中国科学院遗传发育所农业资源研究中心研究员、作物遗传与育种研究室主任，中国土壤学会土壤专业委员会委员。
近年主要研究微生物逆境生物学与环境微生物技术，并在此基础上开发针对第二次绿色革命的环境生物技术，以实现作物重金属安全、农药和化肥替代。迄今发表第一/通讯SCI论文近50篇，获批专利16件。2012年获UQ Postdoctoral Researcher Fellowship，2016年入选中国科学院人才计划，2017年获批河北省杰出青年基金，2022年获聘中国科学院农业资源研究中心特聘骨干研究员岗位。
研究兴趣：生态环境改善和食物污染消减是提高人类健康的重要途径。第一次绿色革命以种质改良和高投入化学品为主要技术驱动，在产量上取得了巨大成功。然而随着人口剧增、土地承载压力持续增加，农业化学品的生态负面效果日益凸显。第二次绿色革命的基本任务就是同时实现产量提高、生态环境改善和农产品质量提升。微生物在土壤环境健康、作物元素累积/促生/抗病方面发挥关键作用，开发基于微生物的农药、化肥替代和重金属消减技术，有望为第二次绿色革命提供科学支撑。
1. 2024 遗传发育所优秀个人
2. 2023 人工智能工程师（中级，工信部）
3. 2023 河北省科技进步三等奖
4. 2021 益海嘉里优秀导师奖
5. 2021 中国生产力促进中心协会“中国好技术”称号
6. 2020 中国生态农业学报年度优秀论文
7. 2020 盐城市创新创业领军人才
8. 2019 盐城国际精英创新创业大赛个人三等奖
9. 2018 中国科学院人才项目择优资助
10. 2018-2020 连续三年遗传发育所优秀个人
11. 2019-2020 连续两年遗传发育所优秀团队
12. 2017 河北省杰出青年基金
13. 2012 UQ Postdoctoral Research Fellow Award
14. 2010 中国科学院“朱李月华”优秀博士生奖
1. 盐城土壤生态研究所 所长（2021.9至今）
2. 中国科学院遗传发育所农业资源研究中心 作物遗传育种研究室 主任 （2023.3至今）
3. 中国土壤学会土壤专业委员会 委员 （2021年至今）
4. iMeta 青年编委 （2022.1至今）
5. 中国生态农业学报 编委 （2017年至今）
6. Frontiers in Environmental Science 客座编辑（2023）
7. 黄海碳研院 理事
8. 中科厚土环境科技有限公司 首席技术专家（2019.6-2023.5）
1.国家自然科学基金专项基金，32250015，小麦主要病害广谱微生物防控技术研究，2023年01月至 2024年 12月，103万，主持
2. 国家自然科学基金区域联合基金，U21A2024，土壤-作物-微生物互作对华北农田镉砷生物地球化学过程的调控机制，2022.01-2025.12，260万，课题主持
3. 国家自然科学基金面上项目，41877414，功能宏基因组学方法表征环境样品镉抗性基因多样性，2019.01-2022.12，56万，主持
4. 中国科学院人才计划项目择优资助，土壤重金属污染生物修复技术，2019.1-2021.12，200万，主持
5. 国家重点研发计划项目，2018YFD0800306，雄安新区农田面源和重金属污染综合防治技术集成示范，2018.7-2020.12，368万，课题主持
6.河北省杰出青年基金，D2018503005，重金属污染农田安全利用：小麦-微生物低吸收体系，2018.1-2020.12，30万，主持
7. 中国科学院水资源重点实验室培育项目，Y826012605，唐河污水库重金属垂向迁移风险评估，2018.1-2019.12， 20万，主持
8. 中国科学院人才计划项目，Y726012203，重金属污染农田安全利用技术，2017.1-2018.12，80万，主持
9. 府河-白洋淀河湖冲积沉积带水与生态环境修复与综合治理，2018 年河北省重点研发计划项目，2017.1-2019.12，课题主持
10. UQ Postdoctoral Research Fund， Biodiversity of microbial community structure in the continuum of tailings landscape，2012.4-2015.12，A$306,000，主持
11. UQ Early Career Researcher Fund， Are fungi pioneers in the colonization of microbial community in base metal mine tailings? 2012.1-2012.12，A$35,000，主持
12. Rare metals Jamaica Limited (RMJL)，Developing options and strategies for red mud bioremediation at Rodinia Resources Pty Ltd，2015.7-2016.3，5万澳元，主要申请人
13. UQ Collaboration and Industry Engagement Fund，Phosphorus Use Efficiency in Sugarcane Genotypes，2011.1-2011.12，6.3万澳元，主要申请人
14. UQ-UWA Bilateral Research Collaboration Award，Engineering biochars for restoring and sustaining soil-plant systems – From mined land to crop fields，2011.1-2012.12，1万澳元，参与人
15. UQ-UWA Bilateral Research Collaboration Award， Rehabilitation in hostile environments: identifying transitional states in the below-ground ecology of mine tailings and residues under revegetation，1.6万澳元，参与人
环境生物技术
1. Xiaofang Li, Xin Zheng,Nikita Yadav, Shouvik Saha, Sayed Salama, Xiangkai Li, Likun Wang*, Byong-Hun Jeon*, Rational Management of the Plant Microbiome for the Second Green Revolution, Plant Communications, 2024, DOI: 10.1016/j.xplc.2024.100812. （第一作者，2023 IF 10.5）
2. Likun Wang, Miaomiao Chen, Xin Zheng, Xiaofang Li*, Comparative genomics of fungal mutants provides a systemic view of extreme cadmium tolerance in eukaryotic microbes. Journal of Hazardous Materials, 2024, https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.133354.（通讯作者，2023 IF 13.6）
3. Li, W., Wang, L., Li, X.*, Zheng, X., Cohen, M.F., Liu, Y.-X.*, Sequence-based Functional Metagenomics Reveals Novel Natural Diversity of Functioning CopA in Environmental Microbiomes. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.gpb.2022.08.006. （通讯作者，2023 IF 9.5）
4. Liu, Y.-X.*, Chen, L., Ma, T., Li, X., Zheng, M., Zhou, X., Chen, L., Qian, X., Xi, J., Lu, H., Cao, H., Ma, X., Bian, B., Zhang, P., Wu, J., Gan, R.-Y., Jia, B., Sun, L., Ju, Z., Gao, Y., Wen, T., Chen, T., 2023. EasyAmplicon: An easy-to-use, open-source, reproducible, and community-based pipeline for amplicon data analysis in microbiome research. iMeta 2(1), e83. （第四作者）
5. Muthu Prabhu, S., Rane, N.R., Li, X.*, Otari, S.V., Girawale, S.D., Palake, A.R., Kodam, K.M., Park, Y.-K., Ha, Y.-H., Kumar Yadav, K., Ali Khan, M., Jeon, B.-H.*, 2023. Magnetic nanostructured adsorbents for water treatment: Structure-property relationships, chemistry of interactions, and lab-to-industry integration. Chemical Engineering Journal 468, 143474. （通讯作者，2023 IF 15.1）
6. Yadav, N., Ahn, H.-J., Rane, N.R., Kurade, M.B., Li, X., Park, Y.-K., Khan, M.A., Chung, W.J., Chang, S.W., Jeon, B.-H.*, 2023. Comprehensive study on removal of bisphenol-S and its metabolic fate using aquatic macrophytes. Chemical Engineering Journal 455, 140967. （第五作者，2023 IF 15.1）
7. Wu, P., Rane, N.R., Xing, C., Patil, S.M., Roh, H.-S., Jeon, B.-H., Li, X.*, 2022. Integrative chemical and omics analyses reveal copper biosorption and tolerance mechanisms of Bacillus cereus strain T6. Journal of Hazardous Materials 435, 129002. （通讯作者，2022 IF 14.22）
8. Chen, J., Wang, L., Li, W., Zheng, X., Li, X.*, 2022. Genomic Insights Into Cadmium Resistance of a Newly Isolated, Plasmid-Free Cellulomonas sp. Strain Y8. Frontiers in Microbiology 12. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.784575. （通讯作者，2022 IF 6.06)
9. Zheng, X., Wang, L., You, L., Liu, Y.-X.*, Cohen, M., Tian, S., Li, W., Li, X.*, 2022. Dietary licorice enhances in vivo cadmium detoxification and modulates gut microbial metabolism in mice. iMeta 1(1), e7. https://doi.org/https://doi.org/10.1002/imt2.7. （通讯作者）
10. Yang, S., Wu, P., Jeyakumar, P., Wang, H., Zheng, X., Liu, W., Wang, L., Li, X.*, Ru, S., 2022. Technical solutions for minimizing wheat grain cadmium: A field study in North China. Science of The Total Environment 818, 151791. （通讯作者，2022 IF 10.75）
11. Zaid, I.U., Muhammad, S.H., Zhang, N., Zheng, X., Wang, L., Li, X.*, 2022. Phenotypic variations of wheat cultivars from the North China Plain in response to cadmium stress and associated single nucleotide polymorphisms identified by a genome-wide association study. Pedosphere 32(4), 555-564. （通讯作者，2022 IF 5.51）
12. Chen, M., Wang, L., Zheng, X., Cohen, M., Li, X.*, 2021. Cross-Kingdom Comparative Transcriptomics Reveals Conserved Genetic Modules in Response to Cadmium Stress. mSystems 6(6), e01189-01121. https://doi.org/doi:10.1128/mSystems.01189-21. （通讯作者，2021 IF 7.33）
13. Zheng, X., Yang, S., Chen, L., Kimotho, R.N., Chen, M., Chen, J., Zhang, J., Li, X.*, 2021. A newly-isolated Cd-loving Purpureocillium sp. strain YZ1 substantially alleviates Cd toxicity to wheat. Plant Soil 464(1), 289-302. （通讯作者，2021 IF 4.99）
14. Wu, P., Wang, Z., Bhatnagar, A., Jeyakumar, P., Wang, H., Wang, Y., Li, X.*, 2021. Microorganisms-carbonaceous materials immobilized complexes: Synthesis, adaptability and environmental applications. Journal of Hazardous Materials 416, 125915. （通讯作者，2021 IF 10.5）
15. Yang, S., Feng, W., Wang, S., Chen, L., Zheng, X., Li, X.*, Zhou, D., 2021. Farmland heavy metals can migrate to deep soil at a regional scale: A case study on a wastewater-irrigated area in China. Environmental Pollution 281, 116977. （通讯作者，2021 IF 9.99）
16. Chen, J.; Xing, C.; Zheng, X.; Li, X*. Functional Genomic Identification of Cadmium Resistance Genes from a High GC Clone Library by Coupling the Sanger and PacBio Sequencing Strategies. Genes 2020, 11, 7. （通讯作者）
17. Xing, C., Chen, J., Zheng, X., Chen, L., Chen, M., Wang, L., Li, X.*, 2020. Functional metagenomic exploration identifies novel prokaryotic copper resistance genes from the soil microbiome†. Metallomics 12(3), 387-395. （通讯作者）
18. Li, X., Islam, M.M., Chen, L., Wang, L., Zheng, X., 2020. Metagenomics-Guided Discovery of Potential Bacterial Metallothionein Genes from the Soil Microbiome That Confer Cu and/or Cd Resistance. Appl Environ Microbiol 86(9). https://doi.org/10.1128/aem.02907-19.（第一作者，当期Spotlights文章）
19. Li, X., Zhou, D., 2019. A Meta-Analysis on Phenotypic Variation in Cadmium Accumulation of Rice and Wheat: Implications for Food Cadmium Risk Control. Pedosphere 29(5), 545-553. （第一作者）
20. Wang, L., Li, X.*, 2019. Steering soil microbiome to enhance soil system resilience. Crit Rev Microbiol 45(5-6), 743-753. （通讯作者，2019 IF 7.35）
21. Li, X.F., 2019. Technical solutions for the safe utilization of heavy metal-contaminated farmland in China: A critical review. Land Degrad Dev 30(15), 1773-1784.（第一作者，2019 IF 7.2）
1. 李小方,双层植物培养装置 中国 ZL 2017 2 0719277.9 (已授权)
2. 李小方, 一种微生物纯培养装置 中国ZL 2017 2 0722170.x (已授权)
3. 李小方，郑鑫, 一种对镉具有高抗性的紫胞菌及提取方法和应用 中国 201711100179.8(已授权)
4. 李小方，陈苗苗,一种高镉抗性平菇菌株及其应用 中国 201810815151.0(已授权)
5. 李小方，陈苗苗, 一种用于富集重金属的菌棒 中国 201821173002.0(已授权)
6. 陈苗苗,李小方，一种高效镉吸附真菌菌剂及其制备方法和应用 中国 201710669924.4(已授权)
7. 李小方，一种土壤污染处理装置，201921359466.5(已授权)
8. 李小方，一种堆肥反应器，202022987799.1，2020-11-10(已授权)
9. 李小方，一种堆肥反应器及其后处理系统，202022973444.7 2020-11-10(已授权)
10. 李小方，陈苗苗，郑鑫，一种高镉抗性大型真菌菌株及其应用，202011052123.1，2020.9.29(已授权)
11. 李小方，一种金属硫蛋白基因M18、其编码得到的金属硫蛋白及其表达和应用，201910290545.x(已授权)
12. 李小方，一种金属硫蛋白基因M27、其编码得到的金属硫蛋白及其表达和应用，201910289757.x(已授权)
13. 李小方，郑鑫, 小茴香水提取物、包含其得组合物及其制备方法和用途 中国 201710895226.6，2022.01.04(已授权)
14. 李小方，郑鑫, 甘草水提取物、包含其的组成物及其制备方法 中国 201710894184.4(已授权)
15. 李小方，一种金属硫蛋白基因M20、其编码得到的金属硫蛋白及其表达和应用，201910289750.x(已授权)
16. 李小方，一种金属硫蛋白基因M16、其编码得到的金属硫蛋白及其表达和应用，201910290546.x(已授权)
17. 李小方, 一种功能基因组克隆子库的测序方法 中国 201910872486.0 2019.9.16
18. 李小方，郑鑫, 一种生物炭基肥及其制备方法和应用 中国 202011437688.1 2020-12-10
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